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粪便与土壤 DNA/RNA 共提取：强抑制复杂基质怎么选试剂盒？
发布时间：2026-11-02
强抑制环境样本
DNA + 总 RNA 同步
磁珠法 · 96 孔自动化
免酚氯仿
DNA + 总 RNA 同步
磁珠法 · 96 孔自动化
免酚氯仿
粪便/土壤 DNA-RNA 共提取
强抑制复杂基质怎么选试剂盒：看四项，别只看得率
货号 YG28011 / YG28011-C · 雅礼生物 YALEPIC® · 仅供研究使用
⏱ 60 秒速览：选型结论
看哪四项
① 抑制剂去除能力 ② 是否支持 DNA/RNA 共提 ③ 能否上自动化 ④ 是否免酚氯仿。只看得率容易踩坑——提得多不等于提得净。
推荐方案
YALEPIC® 磁珠法粪便/土壤 DNA/RNA 共提取试剂盒 YG28011：一份样本、一次流程，同时拿到基因组 DNA 与总 RNA。
要去除的抑制物
腐殖酸、黏多糖、胆红素、蛋白质。A260/A230 低于 1.7 通常强烈提示腐殖酸或多酚残留。
覆盖样本
土壤 9 类（农田土、山林土、淤泥、活性污泥、沉积物等）+ 粪便 7 类（人及小鼠、大鼠、猪、鸡、牛）+ 堆肥、污水、肠道内容物。
一、先判断：你的样本是”强抑制复杂基质”吗
粪便、土壤、淤泥、活性污泥、堆肥这类样本，与血液、培养菌完全不是一个难度等级。如果你的样本符合下面三条中的两条以上，通用试剂盒大概率会出问题：
🟤
抑制剂与核酸性质相近
腐殖酸、黏多糖、胆红素等与目标核酸理化性质接近，纯化时极易共沉淀，残留后会抑制聚合酶——表现为 qPCR Ct 延迟、扩增曲线起不来。
🧱
难破壁微生物占比高
厚壁菌、真菌、芽孢、放线菌的细胞壁坚韧，常规化学裂解覆盖不全，直接导致群落结构失真。
🪨
样本高度非均质
固体颗粒基质，前处理不到位会放大取样误差；土壤每克可含 10⁹–10¹⁰ 个微生物细胞，取样代表性直接决定结论。
二、推荐方案：YALEPIC® 磁珠法粪便/土壤 DNA/RNA 共提取试剂盒
一份样本，两套数据
强抑制样本专用
96 孔自动化
强抑制样本专用
96 孔自动化
YALEPIC® 磁珠法粪便/土壤 DNA/RNA 共提取试剂盒
货号：YG28011（96T）／YG28011-C（96T） · 目录价以实时报价为准
面向粪便、土壤、淤泥、活性污泥等强抑制环境样本。在同一份样本、同一套试剂体系内，一次实验流程即可同时获得基因组 DNA 与总 RNA，不必为两类核酸分别取样、分别前处理。试剂采用优化的磁珠分离技术，配合针对高抑制样本设计的缓冲体系，可有效去除腐殖酸、黏多糖、胆红素、蛋白质等 PCR 抑制物，全程不使用酚/氯仿。
✅ 一份样本，两套数据
DNA 与总 RNA 来自同一份裂解样本，宏基因组与宏转录组结果可直接对应同一取样点，减少分批取样引入的样本间差异。
✅ 强抑制样本专用缓冲体系
针对腐殖酸、黏多糖、胆红素、蛋白质等抑制物优化，减轻抑制物对下游酶反应的干扰。
✅ 适配 96 孔自动化
磁珠法流程可直接上自动化核酸提取仪，适合高通量、多批次样本的标准化处理。
✅ 节省珍贵样本
深层土壤、活性污泥、少量冻存粪便等难以重复获取的样本，无需为 DNA 和 RNA 各消耗一份。
| 参数项 | 指标 |
|---|---|
| 货号 / 规格 | YG28011（96T）、YG28011-C（96T） |
| 方法学 | 磁珠法，一次流程同步提取 DNA 与总 RNA |
| 适用样本（土壤类） | 农田土、山林土、花坛土、花盆土、红黑土、淤泥、粉尘、活性污泥、沉积物 |
| 适用样本（粪便类） | 固态粪便、液态粪便，以及小鼠、大鼠、猪、鸡、牛等动物粪便 |
| 其他环境样本 | 堆肥、污水、肠道内容物 |
| 去除的抑制物 | 腐殖酸、黏多糖、胆红素、蛋白质等 PCR 抑制物 |
| DNA 下游 | PCR、qPCR、16S rRNA 扩增子测序、宏基因组测序、群落结构分析 |
| RNA 下游 | RT-PCR、RT-qPCR、cDNA 合成、宏转录组（RNA-seq）、群落功能活性分析 |
| 保存与运输 | RSL Buffer 常温运输、2~8℃ 保存；其他组分 10~30℃ 常温运输与保存 |
| 有效期 | 18 个月（以产品标签标注的批号效期为准） |
使用YG28011产品，分别从两份不同的土壤样本（200mg）以及粪便样本（100mg）中提取DNA和RNA，取6 μl核酸产物进行琼脂糖凝胶电泳结果显示，YG28011试剂盒提取不同粪便土壤样本的DNA和RNA均具有较高的产率及完整性；
三、选型四问：怎么判断它适不适合你
问 1：柱膜法还是磁珠法？
| 对比维度 | 柱膜法 | 磁珠法 |
|---|---|---|
| 操作方式 | 依赖离心过柱 | 磁性分离，无需离心过柱 |
| 含颗粒裂解液 | 容易堵膜 | 容忍度更高 |
| 自动化适配 | 较难 | 可直接上 96 孔平台 |
| 批量一致性 | 依赖操作手法 | 流程标准化，重复性好 |
| 适合场景 | 少量样本、快速筛查 | 中大批量、队列样本、标准化 |
问 2：DNA 单提，还是 DNA/RNA 共提？
| 对比维度 | 分别单提 | 共提取 |
|---|---|---|
| 样本消耗 | 两份 | 一份 |
| 数据同源性 | 分批取样，存在样本间差异 | 同一取样点，可直接对应 |
| 前处理工作量 | 两次 | 一次 |
| 适合场景 | 只需 DNA、样本充足 | 样本珍贵、需同时做宏基因组与宏转录组 |
问 3：手动还是自动化？
样本量少于十几个、偶发检测，手动磁珠法即可；进入队列研究、多批次环境监测或测序平台批量交付，建议直接上 96 孔自动化。YG28011 采用磁珠法设计，核酸结合于磁珠表面，支持 96 孔板自动化核酸提取平台操作，无需酚/氯仿抽提步骤，上机前按仪器说明完成程序适配与验证即可。
问 4：抑制剂怎么判断去干净了？
① 看 A260/A230
低于 1.7 通常强烈提示腐殖酸、多酚或盐类残留。
② 设内参对照（IAC）
看 Cq 是否相对纯模板发生偏移，判断是否存在抑制。
③ 稀释复检
稀释后 Ct 明显提前，说明原管存在抑制物。
四、覆盖样本类型一览
🌾 农田土
🌲 山林土
🌷 花坛土
🪴 花盆土
🟫 红黑土
💧 淤泥
🌫️ 粉尘
🏭 活性污泥
🪨 沉积物
🧫 固态粪便
💦 液态粪便
🐁 小鼠粪便
🐀 大鼠粪便
🐖 猪粪便
🐔 鸡粪便
🐄 牛粪便
♻️ 堆肥
🚰 污水
🧬 肠道内容物
🌲 山林土
🌷 花坛土
🪴 花盆土
🟫 红黑土
💧 淤泥
🌫️ 粉尘
🏭 活性污泥
🪨 沉积物
🧫 固态粪便
💦 液态粪便
🐁 小鼠粪便
🐀 大鼠粪便
🐖 猪粪便
🐔 鸡粪便
🐄 牛粪便
♻️ 堆肥
🚰 污水
🧬 肠道内容物
五、下游应用：谁在那里 + 谁在工作
DNA 与 RNA 来自同一份裂解样本，这让宏基因组与宏转录组结果可以直接对应同一个取样点——相当于在同一时间、同一位置同时回答两个问题：
🧭 谁在那里（DNA）
通过 16S rRNA 扩增子测序与宏基因组测序解析群落结构：有哪些类群、各占多少比例。
⚡ 谁在工作（RNA）
通过 RT-qPCR 与宏转录组解析群落功能活性：哪些基因正在表达、代谢通路活跃程度如何。
🌱 土壤微生物组
农田、林地、湿地土壤的群落结构与功能解析。
🦠 肠道菌群研究
人及动物粪便样本的菌群组成与活性分析。
🌍 环境监测
污染场地评估、生态调查与长期定位观测。
♻️ 堆肥与污水处理
工艺运行中微生物群落的动态监测与工艺优化。
🐄 动物营养与微生态
畜禽肠道健康评估与粪便菌群监测。
六、上机前必读：得率与片段的权衡
选对试剂盒之后，还有一个操作变量会决定成败：破壁强度。机械研磨时间延长会同时抬高得率、剪短片段——公开文献报道的趋势如下（为文献报道的趋势范围，用于说明规律，非本品实测数据）：
| 裂解方式 | 典型得率（ng/g 土） | 平均片段长度 |
|---|---|---|
| 仅化学裂解 | 50 – 200 | 5 – 15 kb |
| 机械研磨 30 s | 300 – 600 | 10 – 25 kb |
| 机械研磨 180 s | 500 – 900 | 2 – 8 kb |
| 酶解 + 化学 | 150 – 400 | 15 – 40 kb |
怎么用：下游是 qPCR / 16S 扩增子，可偏向得率与覆盖度；下游是 宏基因组建库或长读长测序，应优先保片段完整性，宁可牺牲部分得率。一般土壤建议起始量 0.5 g；含水量较高的底泥因实际土壤含量偏低，可适当增加起始量。
七、常见问题 FAQ
📋 数据声明
文中引用的得率与片段长度数据为公开文献报道的趋势范围，用于说明操作变量的影响规律，属示意性质，非本品实测值。产品实际性能以随货说明书、COA 及第三方检测报告为准；目录价格以实时报价为准。
⚠️ 使用边界
本产品为科研用试剂，仅供研究使用，不用于疾病的诊断、治疗或预防。涉及动物实验须遵守所在机构伦理规范；涉及临床样本或诊断用途的开发，应另行验证并符合相应法规与注册要求。
YALEPIC® 磁珠法粪便/土壤 DNA/RNA 共提取试剂盒
YG28011 / YG28011-C（96T） · 一份样本，同时回答”谁在那里”与”谁在工作”
雅礼（江苏）生物科技有限公司 · www.yalibiotech.com · 目录价以实时报价为准
