游离DNA核酸提取FAQ

血液与游离DNA提取常面临得率、纯度与片段完整性的权衡,磁珠法因通量与一致性成为主流。本专题汇总起始量、洗脱条件与下游建库适配要点。

雅礼官方解答(34 条)

试剂盒提取的 cfDNA 适合做 NGS 建库测序吗?
完全适配。产品针对短片段 cfDNA 定向优化,小片段占比高、无扩增偏好、核酸纯度高,无基因组 DNA 污染,可直接用于 NGS 文库构建、高通量测序及液体活检实验。
尿液、羊水样本可以用这款试剂盒提取 cfDNA 吗?
可以。试剂盒缓冲液体系兼容血浆、血清、羊水、尿液多种无细胞体液,能有效去除尿液杂质、羊水蛋白干扰,稳定纯化高质量游离 DNA。
提取 cfDNA 产量偏低是什么原因?如何提升得率?
① 建议采用cfDNA 专用采血管,采血后 尽快分离血浆,避免白细胞裂解释放 gDNA 污染;② 可适当提升样本起始体积至 3-5ml;③ 严格按照说明书裂解、结合步骤操作,磁珠充分混匀孵育,可小幅提升洗脱体积增加回收量。
洗脱后的 cfDNA 可以长期保存吗?
洗脱后的 cfDNA 建议短期 4℃保存,长期需放置 – 20℃分装冻存,避免反复冻融,可最大程度维持核酸完整性。
提取的 cfDNA 适合做哪些下游实验,是否有抑制剂残留?
纯化产物无蛋白、盐离子等抑制剂残留,可直接用于qPCR 荧光定量、NGS 二代测序、文库构建、无创产前筛查、肿瘤液态活检、甲基化分析等实验。
样本采集后如何保存,会影响 cfDNA 提取得率吗?
新鲜血浆建议分离后短期 4℃保存,长期需 – 20℃分装冻存,避免反复冻融;若无法及时处理血液样本,建议使用 cfDNA 专用稳定剂采血管,防止血细胞裂解释放基因组 DNA 污染。
试剂盒提取是否会造成短片段 cfDNA 丢失,有无片段偏好?
本试剂盒针对短片段 cfDNA 定向优化,自研纳米磁珠可高效捕获小片段核酸,片段覆盖度均匀,无筛选偏好,最大程度保留样本原始核酸信息。
洗脱后的 cfDNA 样品该如何保存,能存放多久?
洗脱后的 cfDNA 短期 4℃可保存 1~3 天,长期建议分装后 – 20℃或 – 80℃冻存,避免反复冻融,防止核酸降解影响下游实验结果。
磁珠法游离DNA大量提取试剂盒最大支持多少体积的样本起始量?
标准适配1~5ml血浆、血清、羊水、尿液等无细胞体液,是大体积 cfDNA 提取专用试剂盒,满足大样本量富集需求。
可以用于全自动核酸提取仪吗?有适配方案吗?
支持手动提取与全自动高通量工作站双模式;同时提供 A/B/C 三款预装型试剂,无需手动配置体系,直接适配主流自动化提取设备,批量处理更高效。
磁珠法游离DNA大量提取试剂盒运输和保存需要冷藏冷冻吗?
无需冷链。支持常温运输,日常 10~30℃室温避光即可保存,无需冷藏冷冻,仓储和使用更便捷。
预装型和普通款试剂盒有什么区别?
普通款为散装试剂,需自行配置体系;A/B/C 预装型为即用型预制试剂,孔板预分装,直接上机使用,节省实验准备时间,更适合高通量自动化实验。
提取过程会用到酚、氯仿等有毒试剂吗?
不会。试剂盒采用温和裂解磁珠纯化法,全程无酚、氯仿、β- 巯基乙醇等有毒有机溶剂,实验安全无污染。
尿液样本应该如何采集和保存以保证cfDNA质量?
 尿液中的游离DNA(cfDNA)在采集后容易降解,因此建议:
  1. 立即处理:采集后应尽快进行核酸提取,最好在4小时内完成。
  2. 使用稳定剂:若无法及时处理,建议使用商业化的尿液稳定剂(如YALEPIC 尿液cfDNA保存等),可在常温下稳定cfDNA长达7-14天,有效防止DNase降解和细胞基因组DNA污染。
  3. 离心去细胞:提取前建议以1,600 × g离心10分钟去除细胞和碎片。
  4. 避免反复冻融:样本应避免反复冻融,以免导致DNA降解。
本试剂盒最低可以检测到多少cfDNA?回收率如何?
 本试剂盒采用高效的纳米磁珠富集技术,针对低丰度cfDNA进行了深度优化,模拟样本回收率可达≥80%,纯化产物无PCR抑制剂残留。健康人尿液cfDNA产量因个体差异较大,本试剂盒的磁珠富集技术可有效回收这些低丰度核酸片段。
提取的cfDNA纯度和片段大小是多少?
 本试剂盒提取的cfDNA产物A260/A280比值在1.7-2.0之间,纯度较高。尿液cfDNA通常以短片段形式存在,主要分布在50-300 bp之间(核心片段约150-200 bp),本试剂盒对低分子量核酸进行了定向优化,可高效回收这些短片段cfDNA。
磁珠法尿液游离DNA大量提取试剂盒是否适配自动化核酸提取仪?
可以。本试剂盒专为自动化提取场景优化,可适配市面主流的磁棒式自动化核酸提取仪,支持1-20ml大体积尿液样本的高通量自动化处理,尤其适合需要同时处理多个样本的实验室场景。
该试剂盒与同类产品(如 Q 牌、Z 牌等)相比有何优势?
 本试剂盒具有以下突出优势:
  • 大体积投入:最大支持20ml尿液样本,而许多竞品仅支持0.5-10ml;
  • 自动化兼容:优化的磁珠法流程完美适配自动化工作站,节省人工操作时间;
  • 高纯度:纳米磁珠+特制缓冲液系统有效去除尿液中的尿素、结晶体等抑制剂;
  • 成本效益:在保证高质量提取效果的同时,提供更具竞争力的价格;
  • 可提供备案版:支持医疗器械备案版本,满足临床转化需求。
试剂盒可以同时提取基因组DNA(gDNA)和游离DNA(cfDNA)吗?
 本试剂盒专为游离DNA(cfDNA)提取设计,直接从尿液上清中纯化cfDNA。如需从同一尿液样本中同时提取gDNA和cfDNA,建议将样本离心分离后分别处理:细胞沉淀用于gDNA提取,上清用于cfDNA提取,可选择搭配专门的尿液基因组DNA提取试剂盒使用。
磁珠法尿液游离DNA大量提取试剂盒应该如何储存?有效期多长?
 本试剂盒在10-30℃室温条件下保存即可,有效期12个月。蛋白酶K组分建议在-20℃长期保存,溶解后可短期室温储存。所有组分避免阳光直射和潮湿环境。常温储存和运输的设计大幅降低了冷链成本,方便实验室日常使用。
磁珠法尿液游离DNA大量提取试剂盒可以分多次使用吗?
 可以。试剂盒按48次规格提供,组分可多次取用。使用时请保持操作环境的洁净,避免交叉污染。开启后的试剂瓶应及时盖紧,按照说明书推荐的储存条件存放。磁珠悬浮液在每次取用前需充分混匀以确保磁珠分布均匀。
提取的cfDNA可以用于哪些下游实验?
本试剂盒提取的cfDNA产物纯度高、无抑制剂残留,可直接用于多种下游分子生物学实验,包括但不限于:qPCR、dPCR(数字PCR)、NGS文库构建、全基因组测序、靶向测序、甲基化检测、基因芯片分析等。
cfDNA提取产物中会有基因组DNA(gDNA)污染吗?
本试剂盒针对cfDNA进行了定向富集设计,有效减少基因组DNA的共纯化。但为了最大程度避免gDNA污染,建议在cfDNA提取前对尿液样本进行充分离心(1,600 × g离心10分钟),以去除细胞和细胞碎片。
提取的cfDNA产量很低,可能是什么原因?应如何解决?
产量偏低可能由以下原因引起:
可能原因 解决方法
样本中cfDNA本底含量低 增加起始样本量至最大允许量(20ml)
尿液样本未经稳定处理,cfDNA已降解 采集后立即处理,或使用尿液稳定剂
磁珠未充分混匀或结合时间不足 使用前充分涡旋磁珠,确保结合时间充分
洗脱体积过小 适当增加洗脱体积以提高总回收率
样本中含有高浓度抑制剂 确保按照说明书步骤充分洗涤
如何评估提取的cfDNA质量?
 建议通过以下方法评估提取的cfDNA质量:
  1. 紫外分光光度法:检测A260/A280比值,应在1.7-2.0之间;
  2. 琼脂糖凝胶电泳:尿液cfDNA通常以弥散条带形式出现在50-300 bp区域;
  3. qPCR检测:使用内参基因(如GAPDH、RNase P)进行扩增,通过Ct值评估产量和纯度;
  4. 片段分析仪:使用Agilent Bioanalyzer或类似设备精确分析cfDNA的片段大小分布。
  5. 对于极低丰度的cfDNA样本,传统的紫外分光光度法可能因灵敏度不足而无法准确检测,建议优先使用荧光定量法(如Qubit)或qPCR法进行定量评估。
磁珠法尿液游离DNA大量提取试剂盒是否有医疗器械备案?
 是的,本产品可提供医疗器械备案版本。备案版试剂盒在组分和生产工艺上与科研版保持一致,但额外满足医疗器械相关的质量体系要求,适用于IVD试剂盒研发、临床检测方法开发等需要合规资质的应用场景。如有医疗器械备案版需求,请联系雅礼生物销售团队。
尿液作为液体活检样本相比血液有哪些优势?
 尿液作为cfDNA来源具有以下显著优势:
  • 完全无创:样本采集无痛、无风险,患者接受度高;
  • 可重复采样:方便进行纵向研究和疾病动态监测;
  • 样本量大:尿液可获取大体积样本,弥补cfDNA丰度低的不足;
  • 背景干净:尿液蛋白浓度仅为血液的约1/1000,提取更容易,PCR抑制剂干扰较少;
  • 感染风险低:尿液对HIV等病原体的传染性远低于血液。
该试剂盒可以提取尿液中的病毒DNA吗?
可以。本试剂盒的磁珠富集技术对多种来源的游离DNA具有广泛的捕获能力,包括尿液中的病毒DNA(如HPV、EBV、巨细胞病毒等),适用于尿液病原体核酸检测等应用。
磁珠法游离DNA小量提取试剂盒适配哪些样本类型,样本起始用量范围是多少?
适配血浆、血清、羊水等无细胞体液;标准起始样本量为0.2~1mL,兼容 EDTA 常规采血管、Streck 等 cfDNA 专用稳定剂采血管采集的血液样本。
磁珠法游离DNA小量提取试剂盒能否用于全自动核酸提取仪,适配哪些通道机型?
完全支持自动化提取,兼容32 通道、96 通道主流核酸提取仪,同时配套优化预装型试剂(A 型 / B 型 / C 型),无需手动配液,直接上机使用。
为什么提取后 Nanodrop 检测浓度偏低,是提取失败吗?
不是提取失败。cfDNA 本身在血浆中天然含量极低,属于微量核酸;Nanodrop 紫外检测灵敏度不足,易出现数值偏低偏差,推荐使用 Qubit 高灵敏荧光定量仪检测浓度,结果更精准。
磁珠法游离DNA小量提取试剂盒储运需要冷链吗,室温保存有效期多久?
无需冷链,支持常温运输;10~30℃室温密封避光保存,未开封状态下有效期稳定,避免放置阴冷潮湿或高于 35℃环境。
预装型和普通款试剂盒有什么区别,该如何选择?
普通款 YM26004 为标配试剂,可自行配置适配手动 / 仪器;YM26004-A/B/C 为预装型,提前分装适配仪器耗材,开盖即用,省去配液步骤,适合高通量批量实验,32T 选 A 型、48T 选 B 型、96T 选 C 型。
提取过程是否需要使用酚、氯仿等有毒试剂?
全程无需酚、氯仿、β- 巯基乙醇等有毒有机溶剂,依靠磁珠吸附 + 专属洗涤缓冲液纯化,操作安全,实验环境更友好。

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