组织与FFPE提取FAQ

组织、细胞与 FFPE 样本需脱蜡与片段化管控。本专题涵盖 DNA/RNA 共提取、石蜡包埋样本的前处理与质控要点。

雅礼官方解答(61 条)

一份样品真的能同时提取DNA和RNA吗?两者是怎么分开的?
可以。本试剂盒采用双柱分提设计:裂解物先经YM基因组DNA吸附柱,基因组DNA被捕获在DNA柱上;随后总RNA经RT柱选择性结合纯化。DNA与RNA分别在不同的离心柱上洗涤、洗脱,分管收集、互不干扰,不需要对同一样本进行二次取样。
与传统酚/氯仿法相比,柱式法共提取有什么优势?
①全程无需酚、氯仿等有毒有机试剂,操作安全;②无需乙醇沉淀,省时;③硅胶膜吸附特异性结合,蛋白、盐离子等杂质去除更彻底;④步骤标准化,多样本并行时结果一致性更好。
适用于哪些样本?用量是多少?
适用于动物组织与培养细胞:动物组织推荐用量10~30 mg(匀浆或液氮研磨处理);贴壁细胞可直接裂解,悬浮细胞离心收集后裂解,用量均≤1×10⁷ 个。样本量过大可能导致裂解不充分或纯化柱过载,请勿超量上样。
提取的DNA和RNA可以用于哪些下游实验?
基因组DNA:酶切、PCR、Southern杂交、芯片分析、高通量测序、分子克隆等;总RNA:RT-PCR、Real Time RT-PCR、Northern Blot、Dot Blot、Poly A筛选、体外翻译、RNase保护分析、cDNA文库构建等。
得到的RNA还需要做DNase处理吗?
本试剂盒通过双柱分提设计,基因组DNA在过柱阶段即被DNA吸附柱捕获,RNA产物的基因组DNA残留低,常规RT-PCR、Real Time RT-PCR可直接使用。如下游实验对DNA残留极为敏感,建议按下游实验要求另行进行DNase处理或设置无逆转录酶对照(-RT对照)加以验证。
RNA洗脱时用什么洗脱液?体积多少合适?
可使用RNase-free ddH2O或YGE Buffer洗脱;YGE Buffer或ddH2O可56℃预热后使用,有助于提高洗脱效率。洗脱体积不应小于30 μl,体积过小会明显降低洗脱回收率。如需高浓度RNA可减少洗脱体积,但不应低于该下限。
首次使用试剂盒需要注意什么?
首次使用前,请按说明书要求向相应洗涤缓冲液中加入无水乙醇,混匀后备用;同时请确认各组分体积与标签一致。洗涤缓冲液未加乙醇直接使用是柱提取类产品最常见的失败原因之一,请务必在首次实验前完成配制。
样本采集后如何保存?RNA容易降解怎么办?
组织样本建议采集后液氮速冻并-70℃保存,避免反复冻融;培养细胞尽量使用新鲜样本。本试剂盒裂解液含异硫氰酸胍,可在裂解时迅速灭活RNase,最大程度保护RNA完整性;样本处理环节越快进入裂解步骤,RNA质量越好。
试剂盒如何保存和运输?保质期多久?
常温运输,10~30℃室温保存即可,无需冷链,避免阳光直射。具体保质期请以产品包装及COA标注为准。
柱式法YB25007与磁珠法共提取产品应该怎么选?
柱式法(YB25007)操作直观、设备要求低(常规台式离心机即可),适合手动处理中少量样本;磁珠法(如YALEPIC® MagEVO系列)易于自动化,适合大样本量与高通量工作站的批量处理。两类产品的DNA与RNA产物均可直接用于常规下游实验,可按实验室通量与自动化条件选择。
YALEPIC 动物细胞/组织总RNA快速提取试剂盒一盒可以做多少次提取?能同时处理动物组织和细胞吗?
本品为标准50T规格(货号YR23017),即一瓶可完成50次RNA提取反应。该试剂盒为组织细胞通用型RNA提取试剂盒,可同时用于动物组织(如肝、脾、肾、脑等软组织,建议用量10-30mg)和培养细胞(贴壁/悬浮细胞均可,建议用量≤1×10⁷个)的总RNA提取,无需分别采购不同试剂盒,使用更加便捷。
该试剂盒可以提取哪些动物组织的RNA?对特殊组织(如脾脏、肾脏)有限制吗?
本品适用于多种常见动物软组织的总RNA提取,包括肝脏、脾脏、肾脏、脑组织、心脏、骨骼肌、肺组织等。但需要注意:DNA含量特别丰富的组织(如肝、脾、肾)建议用量不超过10-20mg,以免影响提取效果和增加gDNA残留风险。
该RNA提取试剂盒整个提取过程需要多长时间?需要特殊设备或低温条件吗?
整个RNA快速提取流程可在7分钟室温条件下完成——从样本裂解到RNA洗脱全程无需预冷离心机、无需冰上操作,所有离心步骤均在室温(15-30℃)下完成,使用常规台式离心机即可(转速≥12,000rpm)。这是该产品“7min室温提取”的核心优势,相较于传统TRIzol法(约1.5小时)和常规柱式法(约30分钟),大幅缩短了实验周期。
提取过程中是否需要用氯仿/苯酚?操作安全吗?
完全不需要。本产品采用硅基质膜柱式纯化技术,全程无需使用氯仿、苯酚及β-巯基乙醇等有毒有害试剂。对于实验室安全管理和操作人员健康非常友好,尤其适合对有机试剂敏感或通风条件有限的实验环境。这一点也是本产品相比传统TRIzol/酚氯仿法RNA提取的核心差异化优势。
该试剂盒提取的RNA纯度高吗?能直接用于qPCR吗?
可以。本试剂盒采用双柱过滤系统——Fast gDNA Filter Columns有效去除基因组DNA,搭配优化后的洗涤缓冲液去除蛋白和盐离子残留。提取的总RNA纯度A260/A280比值通常在1.9-2.1之间,可直接用于RT-PCR、荧光定量PCR(qPCR)、Northern Blot等对纯度要求较高的下游实验。如需完全消除DNA残留(尤其涉及低丰度基因表达分析时),可进一步使用RNase-free DNase I进行柱上或洗脱后消化处理。
该试剂盒可以去除基因组DNA(gDNA)污染吗?如果gDNA残留怎么办?
可以。本试剂盒内置Fast gDNA Filter Columns,可在RNA提取过程中一步式高效去除基因组DNA,无需额外步骤。对于DNA含量特别丰富的样本(如肝、脾、肾组织),建议将起始用量控制在10-20mg以内。若下游实验(如qPCR)对DNA污染高度敏感,可在RNA洗脱后使用RNase-free DNase I进行进一步消化处理。说明书中有详细的操作指导。
该试剂盒如何保存?运输需要冷链吗?
本试剂盒所有组分可在10-30℃室温条件下干燥保存,无需冷藏或冷冻,运输时同样采用常温运输即可,无需冷链支持。这为实验室库存管理带来了极大便利,也降低了运输和储存成本。开封后仍可在室温条件下保存至试剂盒效期结束(详见瓶身标签),但应注意避免反复开盖引入污染。
试剂盒开封后多久有效?可以反复开盖使用吗?
试剂盒各组分的稳定性设计覆盖整个效期(通常为12-24个月,具体以瓶身标签为准)。建议每次使用后将瓶盖及时拧紧,存放于干净干燥的室温环境中。裂解液及洗涤缓冲液应避免长时间暴露于空气,以防溶剂挥发或引入RNase污染。不建议反复冻融试剂组分(所有组分均室温保存,无需冻融)。
如果遇到柱子堵塞或离心困难,可能是什么原因?如何解决?
柱子堵塞通常由以下原因造成:(1)样本投入量过多——请参考推荐的样本用量范围(组织10-30mg,细胞≤1×10⁷个);(2)样本研磨/裂解不充分——建议尽可能研磨充分,必要时可加大裂解液体积并延长裂解时间。取上清过柱时切勿吸取沉淀物。(完整的问题排查表详见页面“疑难解答”部分。)
提取的RNA产量低怎么办?
RNA产量偏低可能由以下因素引起:样本用量过少(可适当增加,但组织勿超30mg、细胞勿超1×10⁷个);样本保存不当导致RNA降解(建议使用新鲜样本或液氮速冻后-85~-65℃保存的样本,避免反复冻融);研磨/匀浆不充分(可加大裂解液体积及裂解时间);洗脱不充分(可将RNase-free ddH₂O加至膜中央,减少洗脱体积,56℃预热洗脱液或室温延长放置时间,亦可进行二次洗脱提高产量)。
该试剂盒提取的RNA可以用于哪些下游实验?
提取的总RNA纯度高、完整性好,可广泛应用于多种分子生物学下游实验,包括但不限于:逆转录PCR(RT-PCR)、实时荧光定量PCR(qPCR/Real-Time RT-PCR)、基因芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、Poly(A)RNA筛选、体外翻译、RNase保护分析及分子克隆等。提取产物可直接用于后续实验或于-85~-65℃条件下长期保存备用。
什么是FFPE样本?为什么从FFPE样本中提取DNA很困难?
FFPE是福尔马林固定、石蜡包埋的英文缩写,是病理学中长期保存组织样本的标准方法。过去数十年积累了海量FFPE生物样本资源,蕴含丰富的疾病信息。

从FFPE样本提取DNA的核心挑战在于:①福尔马林固定过程中甲醛与DNA和蛋白质发生交联,DNA被化学“锁定”;②长期的常温储存会进一步加速DNA的降解和片段化;③石蜡包埋后脱蜡过程若使用二甲苯等有机溶剂,可能损伤样本;④样本量通常极其有限且珍贵。YALEPIC® MagEVO试剂盒通过优化裂解条件和去交联步骤,有效应对上述挑战,实现从珍贵FFPE样本中高效提取高质量DNA。

YALEPIC® MagEVO试剂盒提取的DNA能否用于NGS测序?
可以。YALEPIC® MagEVO试剂盒提取的DNA纯度高、片段完整性良好,完全适配NGS文库制备流程。测试数据表明,提取产物A260/280比值在1.8-2.0之间,可有效去除PCR抑制剂,确保下游测序的文库构建效率和测序数据质量。建议在NGS文库制备前使用Qubit荧光计进行准确定量评估。
试剂盒提取的DNA可以用于qPCR检测吗?
完全可以。MagEVO试剂盒提取的DNA去除了福尔马林交联引起的扩增抑制物,提取产物可直接用于qPCR和Real-time PCR检测。得益于高效的去交联步骤,扩增产物长度可达1kb,在基因表达定量和突变检测中表现稳定可靠。
产品需要用到二甲苯吗?对人体有危害吗?
完全不需要。YALEPIC® MagEVO试剂盒采用创新型无毒化学脱蜡剂替代传统二甲苯,整个提取过程不涉及任何有毒有机溶剂,对实验人员健康无危害,也无需特殊的通风橱设备。这不仅保障了实验室安全,也避免了二甲苯可能造成的组织萎缩、硬化和脆化问题,同时符合绿色环保实验室的建设理念。
提取一份FFPE样本大约需要多长时间?
使用YALEPIC® MagEVO试剂盒从FFPE组织切片提取DNA,整个操作流程约30-40分钟即可完成。无需过夜孵育,比传统过夜消化方法节省大量时间,显著提升实验室工作效率。
试剂盒的运输和保存条件是什么?对实验室普通冰箱有要求吗?
本试剂盒可在10-30℃常温条件下进行运输和保存,无需冷链或特殊冷藏设备,物流成本和储存成本更低。试剂盒各组分严禁冷冻,使用前请充分混匀。室温保存有效期长达24个月。
每次实验应该使用多少FFPE组织切片?推荐厚度是多少?
推荐使用5-8张FFPE组织切片,切片厚度为5-10μm,切片总面积约1×1cm²,总组织量不超过20mg。切片厚度建议控制在20μm以内。对于不同类型的组织,可根据组织细胞密度适当调整切片数量。
提取的DNA预期得率是多少?
DNA得率取决于多种因素,包括组织来源、样本保存时间、固定条件、切片厚度等。在优化条件下,从5-8张5-10μm厚度的FFPE切片中可提取2-8μg基因组DNA,不同组织类型间存在差异,肿瘤组织通常得率较高,纤维化组织相对较低。
提取产物的纯度和浓度如何检测?推荐使用什么方法?
推荐使用以下方法进行质量检测:
  • 浓度检测:建议使用Qubit荧光计搭配dsDNA HS检测试剂盒,可特异性定量双链DNA,不受RNA或蛋白质干扰。YALEPIC® 1×dsDNA高灵敏检测试剂盒CAT#YNQ24091
  • 纯度评估:使用NanoDrop分光光度计检测A260/280比值,理想范围为1.8-2.0
  • 完整性分析:对于NGS等高要求应用,建议使用生物分析仪进行DNA片段分布分析
提取的DNA可以保存多久?长期保存有什么建议?
提取纯化后的DNA建议分装保存在-20℃,避免反复冻融。在-20℃条件下可稳定保存至少2年。如需长期存档,建议-80℃超低温保存。使用无核酸酶(DNase/RNase-free)的储存管,并尽量避免DNA溶液长时间暴露在室温。
这个试剂盒是否支持自动化核酸提取仪?
YALEPIC® MagEVO试剂盒采用磁珠法纯化技术,完全兼容市面主流自动化核酸提取仪。磁珠法自动化方案相较于手工操作可显著提升通量和结果重复性。
什么是”DNA/RNA 共提取”?和只提 DNA 或只提 RNA 的试剂盒有什么不同?
常规核酸提取试剂盒通常只回收单一类型核酸——提取 DNA 的试剂盒会在流程中去除 RNA,提取 RNA 的试剂盒则会通过 DNase I 消化去除 DNA。而共提取试剂盒的目标是同时保留两者:本产品在同一管内同步完成基因组 DNA 与总 RNA 的吸附与洗脱,不设置降解任一方的步骤,因此一份样本即可得到同时含 DNA 和 RNA 的总核酸。对于样本量充足的研究,分别提取并不困难;但当面对穿刺、活检、少量原代细胞、珍稀临床样本时,把一份样本拆成两份往往意味着两边都量不足。共提取方案正是为这类场景设计——一份样本、一次提取、两种核酸。
一次提取出来的是混合核酸吗?DNA 和 RNA 会互相干扰吗?
洗脱产物为同时含有基因组 DNA 与总 RNA 的混合核酸溶液,二者共存于同一管中,互不降解,也互不影响各自的定量检测。下游使用时按需取样即可:

▸ 检测 DNA 靶标(基因型鉴定、病原 DNA 检测):直接取样做 PCR / qPCR;
▸ 检测 RNA 靶标(基因表达分析、病毒 RNA 检测):取样先经反转录得到 cDNA,再进行 RT-qPCR。

需注意,由于洗脱液中同时存在 DNA 与 RNA,若使用 Nanodrop 等紫外法测定浓度,读数反映的是两者总量;如需分别准确定量 DNA 与 RNA,建议使用 Qubit 等特异性荧光定量方法。

可以用哪些样本?每次推荐加多少?
本产品适用于动物组织与培养细胞两大类样本:
样本类型 推荐投入量 举例
动物组织 10~30 mg 肝、肾、心、脾、肺、脑、肌肉、皮肤、脂肪组织等
培养细胞 1×10⁶~1×10⁷ 个 贴壁细胞、悬浮细胞、原代细胞

样本量过少会导致核酸总量偏低;投入量过多则可能超出裂解与结合体系承载能力,反而降低纯度与回收率。具体推荐用量请以随货说明书为准。

提取的核酸纯度如何?能做哪些下游实验?
本产品采用独特的裂解与结合缓冲体系,使核酸高效特异地结合于磁珠表面,经多步洗涤去除杂质后洗脱,产物纯度高、质量稳定,不含蛋白质、核酸酶和其他杂质,适用于各类分子生物学实验:

▸ PCR / qPCR:基因型鉴定、拷贝数分析、病原核酸检测;
▸ RT-qPCR:基因表达定量分析;
▸ 测序文库构建:扩增子测序、转录组测序前的模板制备。

若下游实验对核酸完整度或纯度有更高要求(如长片段扩增、建库),建议先通过电泳或 Agilent 2100 评估产物状态,必要时进行优化。

提取过程中需要用到酚、氯仿等有机溶剂吗?
完全不需要。本产品依托磁珠吸附与专属缓冲液体系完成裂解、结合、洗涤与洗脱,全程不接触苯酚、氯仿、异丙醇等有毒有机溶剂,无需进行相分离操作。这不仅降低了对操作人员的健康风险,也避免了有机试剂残留对下游酶反应(如 PCR 聚合酶、反转录酶)的抑制,同时操作无需在强制通风橱内进行。
支持自动化高通量提取吗?一次能处理多少样本?
支持。本产品为 96T 规格设计,适配自动化核酸提取工作站,可对批量样本进行高通量处理,显著减少人工操作、降低人为误差并提升批间一致性,适合常态化、大批量的样本检测场景。关于具体适配的仪器型号、运行程序设置,以及是否提供预装试剂板形态,请联系雅礼生物技术支持获取对应方案。
需要冷链运输和低温保存吗?
不需要。本产品全组分支持常温运输,日常存放只需置于 10~30℃ 室温避光环境,无需占用冰箱或冷链存储空间,储存条件宽松,适合各类型实验室(包括硬件条件有限的基层实验室)使用。

储存时请注意避免高温(>40℃)与阳光直射;具体产品有效期以标签标注为准。

核酸得率偏低,可能是什么原因?如何优化?
可从以下环节逐一排查:
可能原因 优化建议
样本投入量不足 调整至推荐范围(组织 10~30 mg、细胞 1×10⁶~1×10⁷ 个)
组织裂解不充分 组织建议液氮研磨至粉末状,或用电动匀浆器充分匀浆,使其完全分散
磁珠取用前未混匀 磁珠悬液取用前必须充分涡旋或颠倒混匀,否则实际磁珠量不足
磁分离时误吸磁珠 弃上清前确认磁珠已被充分吸附,吸取动作避免扰动磁珠
洗脱不充分 加入洗脱液后室温孵育 2~5 分钟,必要时加热辅助洗脱或进行二次洗脱
样本反复冻融 核酸已降解;建议样本分装保存,避免反复冻融
脂肪组织、胰腺这类难提取样本怎么处理?
本产品对常规动物组织均具有良好提取效果。对于脂肪含量高或 RNase 含量高(如脂肪组织、胰腺、脾脏)的样本,建议:

▸ 增加裂解液用量:脂质成分可能干扰磁珠对核酸的结合,可适当提高裂解液比例;
▸ 强化裂解操作:组织在液氮中充分研磨至粉末状,或使用手持匀浆器高速匀浆 30~60 秒,确保完全分散;
▸ 增加洗涤次数:磁分离后额外增加一次洗涤步骤,更彻底地去除残留脂质。
具体参数请以随货说明书为准,也可联系技术支持获取针对特定组织的优化建议。

我需要同时做基因组和转录组分析,或样本非常珍贵,选这款合适吗?
非常适合。这正是本产品的设计初衷:

▸ 节省样本:不必把有限的样本一分为二,一次提取即同时获得 DNA 模板与 RNA 模板;
▸ 数据可比性更好:DNA 与 RNA 来自同一次提取、同一份样本,避免分批提取带来的批间差异;
▸ 适配珍稀场景:穿刺组织、活检样本、少量原代细胞、难以重复取材的临床样本。

若您的研究只需要单一类型核酸(例如仅做 RNA 表达分析且对 gDNA 残留极为敏感),选择带有 DNase I 消化步骤的专用 RNA 提取试剂盒针对性会更强。

这款磁珠法 DNA 提取试剂盒适配哪些样本类型?
主要适配新鲜动物组织(鼠尾、肌肉、脏器等 10-30mg)和常规培养细胞(≤1×10⁶个),不适用石蜡固定组织、血液样本,如需其他样本可咨询客服推荐。
试剂盒提取的 DNA 能直接做高通量测序吗?
可以。试剂盒提取的基因组 DNA 片段完整、纯度高,260/280 比值稳定在 1.8-2.0 之间,无杂质污染,可直接用于宏基因组文库构建、全基因组测序、荧光定量 PCR 等高端实验。
是否支持自动化高通量提取仪器使用?
支持。兼容市面主流移液法自动化核酸提取仪、磁棒法全自动提取工作站,32T/48T/96T 预装款可直接上机,无需手动配制试剂,适配批量样本检测。
试剂盒保存和运输需要冷链吗?
不需要。产品支持常温运输,日常存放只需置于 10-30℃室温避光保存即可,无需冷冻冷藏,储存条件宽松。
提取整个流程大概需要多长时间?操作复杂吗?
操作极简,样本直接裂解无需繁琐孵育,全程 1 小时内即可完成 DNA 提取纯化,新手也可快速上手,无需专业实验基础。
试剂盒有几种规格?可以小批量采购吗?
共有 32T 预装 A 型、48T 预装 B 型、96T 标准版 / 预装 C 型四种规格,支持小批量采购,也可提供批量定制报价,满足不同实验室样本通量需求。
提取 DNA 纯度不达标、有蛋白污染是什么原因?
大概率是样本取样过量、裂解不充分或洗涤步骤操作不当;建议严格按照说明书控制 10-30mg 组织样本量,充分涡旋裂解,规范完成洗涤步骤即可规避污染问题。
和传统离心柱法 DNA 提取试剂盒相比有什么优势?
相比离心柱法,磁珠法更适配自动化高通量操作,无堵柱风险;无需酚氯仿有毒试剂,更安全;耗时更短、DNA 回收率与完整性更佳,适合大批量样本常态化提取。
使用MagEVO RNA提取试剂盒提取的总RNA出现降解,电泳显示条带弥散或无清晰条带,可能是什么原因?如何解决?
RNA降解通常由以下原因引起:
  1. 样本保存不当:动物组织离体后未及时冷冻或加入裂解液,导致内源性RNase被激活。建议取样后立即置于液氮中速冻,或直接加入试剂盒提供的裂解液中进行匀浆处理。

  2. RNase污染:实验过程中使用的枪头、离心管、移液器、工作台面等可能引入外源性RNase。建议使用无RNase认证的实验耗材,操作时佩戴手套并经常更换,使用DEPC处理水配制相关试剂。

  3. 样品反复冻融:样本多次冻融会破坏RNA完整性。建议将样品分装保存,避免反复冻融。

  4. 操作剧烈:涡旋震荡或吹打过于剧烈可能导致RNA机械断裂。建议裂解后轻弹混匀,吹打时保持温和。

RNA提取后得率偏低(Nanodrop检测浓度<50 ng/μL),如何提高RNA产量?
RNA得率偏低可从以下几个方面排查和优化:
  1. 样品用量不足:请确认动物组织用量在15~25 mg范围内,培养细胞在1×10⁶~1×10⁷个范围内。过少的样本量会导致RNA总量偏低。

  2. 裂解不充分:动物组织样本建议液氮研磨至粉末状再加入裂解液,或用电动匀浆器充分匀浆;培养细胞加入裂解液后应充分吹打至细胞完全裂解,无明显团块。

  3. 磁珠洗涤损失:磁分离洗涤过程中,应确保磁珠充分被磁力架吸附后再弃去上清,避免磁珠被误吸走。弃上清时使用移液器小心吸取,避免扰动磁珠。

  4. 洗脱条件优化:加入洗脱液后,建议在室温孵育2~5分钟,必要时可于55~65℃加热2~3分钟以增强洗脱效率。必要时可进行二次洗脱以提高回收率。

提取的RNA经Nanodrop检测A260/A280比值偏低(<1.8)或偏高(>2.1),表示什么?如何改善RNA纯度?
A260/A280比值是评估RNA纯度的重要指标:
  • 比值<1.8:通常表示存在蛋白质、多糖或苯酚污染。建议措施:①确保裂解完全后再进行磁珠结合;②适当增加洗涤次数(使用试剂盒提供的洗涤液I和洗涤液II);③避免在磁分离时吸入蛋白沉淀层。

  • 比值>2.1:通常表示RNA已发生降解,或存在盐离子残留。建议措施:①遵循Q1中的RNA降解解决方案;②确保洗涤后磁珠充分干燥(可短暂离心后用移液器吸净残留洗涤液),避免乙醇残留影响读数。

理想情况下,高品质RNA的A260/A280比值应在1.9~2.1之间。

进行qRT-PCR实验时,无模板阴性对照出现扩增信号,可能是DNA污染所致。MagEVO试剂盒如何去除基因组DNA?
MagEVO动物细胞/组织总RNA提取试剂盒内置了DNase I消化步骤,可有效去除残留的基因组DNA。具体建议如下:
  1. DNase I消化:按照说明书操作,在磁珠结合RNA后,加入DNase I反应液进行柱上/磁珠上消化,确保消化时间充分(通常为15分钟,室温)。

  2. DNase I失活:消化后需彻底洗涤以去除DNase I及其反应产物,避免其对后续反转录酶产生抑制。

  3. 引物设计策略:若实验对DNA残留极其敏感(如检测低丰度基因或内含子跨越设计受限),建议设计跨内含子引物或使用DNase I处理后的RNA作为模板设置“无反转录酶(No-RT)”对照组,以监控DNA残留情况。

使用自动化核酸提取仪时,MagEVO预装型试剂板(YMR91001-A/B/C)如何操作?适配哪些型号的仪器?
MagEVO预装型试剂板为用户提供了即开即用的便捷体验:
  1. 产品形式:预装型A/B/C分别为32T/48T/96T规格的预分装板式试剂,磁珠、裂解液、洗涤液、洗脱液均已按程序排布于96孔板中,用户仅需加入预处理后的样本即可上机运行。

  2. 适配仪器:本产品经过广泛验证,兼容市面上主流的自动化核酸提取仪,包括但不限于:雅礼生物YALEPIC Pure 系列自动化提取仪、Thermo Scientific KingFisher系列、天隆、博日、奥盛等品牌的磁棒式核酸提取仪。具体运行程序可联系雅礼生物技术支持获取。

  3. 操作要点:使用预装型试剂板前,请撕除板封膜,检查各孔试剂量是否完好。样本裂解后转移至样本孔中,按照仪器程序设置运行。运行结束后,收集洗脱孔中的RNA溶液,分装保存于-80℃或直接用于下游实验。

MagEVO磁珠法RNA提取试剂盒与传统的TRIzol/氯仿法相比,有何优势?
与传统TRIzol/氯仿法相比,MagEVO磁珠法具有以下显著优势:
对比项 TRIzol/氯仿法 MagEVO磁珠法
实验时间 60分钟 40分钟
有机溶剂使用 需要氯仿、异丙醇等有毒试剂 全程无需有机溶剂
操作步骤 多步离心、相分离,操作复杂 磁分离,步骤简化
自动化适配 难以自动化 可适配自动化提取仪,实现高通量
核酸纯度 可能存在有机溶剂残留风险 无有机溶剂残留,纯度高
RNase防护 过程中暴露风险较高 封闭体系操作,RNA更稳定

因此,对于追求操作效率、实验安全性及高通量处理的实验室,MagEVO磁珠法RNA提取试剂盒是更理想的选择。

MagEVO RNA提取试剂盒的保存条件是什么?不同组分是否可以长期常温保存?
本试剂盒各组分保存条件存在差异,请严格按照以下要求执行:
  1. -20℃保存组分:DNase I 及10× DN Buffer。上述组分低温运输到达后,若无立即使用计划,请置于-20℃冰箱保存。DNase I溶解后建议分装成单次用量,避免反复冻融导致酶活下降。

  2. 室温保存组分:磁珠悬液、裂解液、洗涤液、洗脱液等其他所有组分,可在10~30℃室温条件下长期保存。请避免高温(>40℃)或阳光直射环境。

  3. 特别提示:试剂盒开封后,请按上述条件分类保存各组分,并在标签标注的有效期内使用完毕。长期未使用的DNase I若出现沉淀或活性下降,建议更换新批次。

对于脂肪含量较高的动物组织(如脂肪组织、脑组织等),MagEVO试剂盒是否适用?有何特殊操作建议?
MagEVO动物细胞/组织总RNA提取试剂盒对常规组织样本均具有良好的提取效果。对于脂肪含量较高的特殊样本,建议采取以下优化措施:
  1. 增加裂解液用量:脂肪组织中的脂质成分可能干扰磁珠对核酸的结合效率。建议在15~25 mg脂肪组织中,将裂解液用量增加至500~600 μL(常规为400 μL)。

  2. 加强裂解操作:脂肪组织建议在液氮中充分研磨至粉末状,或使用手持匀浆器在裂解液中高速匀浆30~60秒,确保组织完全分散。

  3. 增加洗涤次数:磁分离后,可额外增加一次洗涤液I洗涤步骤,以更彻底地去除残留脂质成分。

  4. 确保裂解液充分浸润:裂解时确保裂解液完全覆盖组织粉末,充分混匀后室温裂解5~10分钟,必要时可于65℃加热5分钟辅助裂解。

提取的RNA用于NGS(二代测序)文库构建时,对RNA质量有哪些要求?MagEVO产品能否满足?
二代测序对RNA起始质量有较高要求,主要体现在以下方面:
  1. 纯度要求:A260/A280比值应在1.9~2.1之间,A260/A230比值≥2.0,无胍盐、乙醇、洗涤剂等残留。MagEVO试剂盒提取的RNA经严格洗涤后,无上述污染物残留,完全符合NGS文库构建要求。

  2. 完整性要求:RIN值(RNA Integrity Number)应≥8,电泳图中28S条带亮度约为18S条带的2倍。MagEVO产品提取RNA的RIN值经Agilent Bioanalyzer检测可达8.5以上。

  3. 无DNA残留:微量DNA残留可能被错误计入转录本定量结果。本产品内置DNase I消化,可有效消除gDNA污染。

  4. 推荐用量:NGS建库通常需要100 ng~1 μg的总RNA,对应于本产品推荐的细胞/组织用量范围。请根据具体建库试剂盒要求调整样本起始量。

使用MagEVO RNA提取试剂盒时,磁珠的长期保存和使用稳定性如何?磁珠是否容易聚集沉淀?
MagEVO系列产品使用的超顺磁性纳米磁珠经过特殊表面修饰和悬浮配方优化,具有以下特性:
  1. 长期稳定性:在推荐的10~30℃室温保存条件下,磁珠悬液可稳定保存12个月以上。使用前请充分涡旋震荡或颠倒混匀,确保磁珠均匀分散后取用。

  2. 抗聚集性能:本产品使用的磁珠表面亲水性修饰与悬浮稳定剂配方,可有效防止磁珠在长期静置后的不可逆聚集。如发现轻微沉降,混匀后即可恢复均一悬浮状态。

  3. 使用注意事项:请勿将磁珠悬液置于冷冻环境,冷冻会破坏磁珠悬浮稳定性,导致磁珠聚集。每次取用前必须充分混匀,取用后立即盖紧瓶盖,避免灰尘和RNase污染。

得到的RNA还需要做DNase处理吗?
本试剂盒通过双柱分提,基因组DNA在过柱阶段即被DNA吸附柱捕获,RNA产物的基因组DNA残留低,常规RT-PCR、Real Time RT-PCR可直接使用。如下游实验对DNA残留极敏感,建议设置无逆转录酶对照(-RT对照)加以验证,必要时再行DNase处理。

行业通用技术要点

以下内容为业界通用的技术原理与操作经验,用于补充理解,不构成对具体产品的指向。

FFPE 样本 DNA 为何片段化严重?
甲醛固定引起 DNA 与蛋白质交联、石蜡包埋加剧断裂,提取所得片段多在数百 bp;需脱蜡、逆转交联并选择片段化耐受的方案,预期片段约 100–500 bp。
FFPE 提取前如何处理石蜡?
通常先以替代溶剂或加热法脱蜡、梯度乙醇复水,再经蛋白酶 K 消化;脱蜡不彻底会显著抑制蛋白酶与聚合酶活性、降低得率,需充分脱蜡。

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