体液样本DNA提取FAQ

尿液、唾液等体液的游离核酸浓度低、易降解。本专题涵盖采集量、保存条件与纯度对高通量测序的要求。

雅礼官方解答(34 条)

YALEPIC®
Script X cDNA第一链合成试剂盒适用于哪些实验?

适用于RT-PCR、RT-qPCR基因表达分析、全长cDNA克隆、RNA-seq文库构建、杂交等多种下游应用。特别适合具有复杂二级结构的RNA模板及低丰度基因的逆转录。

唾液样本采集时有哪些注意事项?
 采集唾液样本时,建议注意以下几点:
  1. 采集前30分钟内避免进食、饮水、吸烟或咀嚼口香糖,以免影响DNA质量;

  2. 采集前可用清水轻轻漱口,去除口腔中的食物残渣;

  3. 建议采集200~500 μL新鲜唾液作为起始样本量(可根据实验需求适当调整);

  4. 采集后如无法立即提取,可将唾液与唾液保存液按推荐比例混合(通常为1:1),室温保存可达数周至数月而不影响DNA质量;

  5. 避免唾液中混入过多气泡,气泡可能导致样本体积计量不准。

本试剂盒可提取的最小唾液样本量是多少?
本试剂盒优化的缓冲体系可处理200~500 μL唾液样本,推荐标准用量为400 μL。如需处理微量样本(如低于200 μL),建议使用唾液保存液或PBS补齐至标准体积后进行提取,或在说明书指导下按比例缩小各试剂的用量。对于极微量样本(如<50 μL),建议选择专门为微量样本设计的DNA提取试剂盒。如需进一步指导,请联系雅礼生物技术支持。
提取的DNA纯度和浓度是否满足二代测序要求?
可以满足。本试剂盒提取的唾液基因组DNA经严格的洗涤步骤充分去除了蛋白质、多糖、脂质及其他PCR抑制剂,A260/A280比值通常在1.7~2.0之间,A260/A230比值>1.8,DNA片段大小>15 kb,完全符合二代测序文库构建的质量要求(如Illumina、MGI等平台)。已有用户使用本产品提取的唾液gDNA成功完成了全外显子测序文库构建和上机测序。若需要用于NGS,建议在文库构建前进行DNA浓度精确定量(推荐Qubit荧光定量法)。
试剂盒是否可用于提取口腔拭子样本中的DNA?
本试剂盒专为唾液样本设计,但也适用于口腔拭子样本的DNA提取。对于拭子样本,建议将拭子头剪下放入离心管中,加入裂解液和蛋白酶K后充分振荡以释放细胞,后续操作与唾液样本完全一致。如需专门用于拭子样本的高通量提取,可参考雅礼生物其他核酸提取产品线。
试剂盒为什么不含RNase A?如果我想获取总RNA怎么办?
 本试剂盒默认不含RNase A,原因如下:
  1. 部分下游应用(如同时分析DNA和RNA、RNA干扰研究等)需要在提取过程中保留RNA组分;

  2. 不含RNase A的试剂盒可为用户提供更大的实验灵活性,用户可根据实际需求选择是否添加RNase A。

如需获取总RNA: 用户可在裂解步骤后向样本中加入适量RNase A溶液(试剂盒未提供,需自备或另购),37℃孵育15~20分钟后继续后续操作。如需在提取DNA的同时保留RNA用于后续检测,建议使用专门为DNA/RNA共提取设计的试剂盒。

试剂盒的常温保存稳定性如何?开封后可以保存多久?
本试剂盒在未开封情况下可在10℃~30℃室温条件下稳定保存12个月。开封后,各组分在正确储存条件下(裂解液、洗涤液、洗脱液室温保存;蛋白酶K建议-20℃保存)仍可使用至标示的有效期。建议每次使用后立即盖紧瓶盖,避免污染和试剂挥发。洗涤液2浓缩液开封后请立即加入指定体积的无水乙醇,标记加醇日期,加醇后室温保存,并在6个月内使用完毕。具体有效期以产品外包装标签为准。
提取的DNA中是否含有PCR抑制剂?如何判断?
 本试剂盒包含优化的洗涤体系,经过两步洗涤步骤可有效去除蛋白质、多糖及其他酶促反应抑制剂。提取的DNA可直接用于PCR、qPCR等酶促反应,无需额外纯化。如需验证是否存在PCR抑制剂,可采用以下方法:
  1. 内参扩增对照法: 将已知浓度的标准DNA模板与等量提取的DNA混合后进行PCR扩增,比较扩增效率;

  2. A260/A230比值法: A260/A230比值<1.8提示可能存在胍盐、多糖或其他抑制物残留;

  3. 浓度梯度稀释法: 将提取的DNA进行梯度稀释后进行PCR,观察扩增曲线是否呈线性关系。

产品是否支持自动化提取或高通量操作?
本试剂盒基于离心柱法手动操作设计,适合中小通量样本处理(50T规格)。如您需要高通量自动化提取解决方案,雅礼生物可提供磁珠法唾液基因组DNA提取试剂盒产品 YALEPIC® 磁珠法唾液DNA提取试剂盒 CAT#YM26010,请访问雅礼生物官网或联系销售获取详细信息。
提取的DNA能否长期保存?保存条件是什么?
 提取纯化后的唾液基因组DNA可在以下几种条件下长期保存:
  • -20℃保存: 溶解于洗脱液或无核酸酶水中,可保存6~12个月,适合中短期存储;

  • -80℃保存: 可长期保存(数年以上),建议分装为小管以避免反复冻融导致的DNA降解;

  • 4℃短期保存: 提取后3~5天内使用的DNA可暂存于4℃。

如何提高低丰度唾液样本的DNA得率?
 对于低丰度DNA的唾液样本(如老年人、干燥综合征患者、长期服药人群等),可尝试以下优化措施提高得率:
  1. 增加样本起始量: 在不超出离心柱载量(通常≤30 μg DNA)的前提下,适当增加唾液样本体积至600~800 μL;

  2. 优化裂解时间: 将裂解步骤延长至15~20分钟,必要时提高裂解温度至65℃;

  3. 减少洗脱体积: 采用50 μL(而非100 μL)洗脱液洗脱,提高DNA浓度;

  4. 两次洗脱合并: 用30~40 μL洗脱液洗脱两次,合并收集管中的DNA溶液;

  5. 洗脱液预热: 将洗脱液预热至65~70℃后再加入吸附柱,可提升洗脱效率;

  6. 延长洗脱孵育时间: 加入洗脱液后室温放置2~5分钟再离心,确保DNA充分溶解。

试剂盒是否适用于含保存液的唾液样本?
 适用。本试剂盒明确标注适用于“唾液/保存液混合液”样本的基因组DNA提取。商业化唾液保存液,通常包含稳定细胞膜、抑制核酸酶活性的成分,与试剂盒的裂解缓冲体系兼容。建议在使用前咨询保存液供应商确认其成分与本试剂盒的兼容性。对于未经测试的保存液品牌,建议先取少量样本进行预实验验证。
YALEPIC®
MagEVO 磁珠法唾液DNA提取试剂盒适用于哪些类型的样本?

本试剂盒适用于新鲜唾液样本、含保存液的唾液样本以及口腔拭子样本。样本收集过程无痛、无创,受试者仅需吐取适量唾液即可完成采样,既适用于医院检验科和第三方医学检验所的批量检测,也适用于科研院校的遗传学研究及法医鉴定机构的人员筛查。

本试剂盒的提取产量和纯度如何?能否用于下游NGS实验?
本试剂盒从200-400 μL唾液样本中可提取2-10 μg基因组DNA(因个体差异而异),OD260/280比值稳定在1.8-2.0之间,充分证明产物纯度优异。提取的基因组DNA可直接用于qPCR定量分析、二代测序(NGS)文库构建、基因分型、STR分析和基因芯片检测等下游实验,无PCR抑制剂残留干扰。
手工操作需要多长时间?自动化提取需要多长时间?
手工操作流程(包括样本裂解消化、磁珠结合、洗涤、洗脱等全步骤)约需60分钟;若使用自动化核酸提取仪,单次运行96样本的提取时间仅需40分钟。相比传统酚氯仿法的2-3小时,本产品显著缩短了实验周期,提升了实验室工作效率。
本试剂盒与传统柱式法相比有什么优势?
本试剂盒采用磁珠法纯化技术,与传统的硅胶膜柱式法相比具有三大显著优势:第一,无需离心——磁分离技术彻底规避了离心柱堵塞风险,尤其适合处理粘稠度较高的唾液样本;第二,自动化兼容性好——可无缝对接各类核酸提取仪,实现高通量无人值守自动化提取;第三,得率和纯度双优——磁珠的大比表面积确保DNA结合效率最大化,洗涤步骤充分去除抑制剂,保证产物质量。
提取的DNA可以用于哪些下游应用?
本试剂盒提取的高纯度基因组DNA可广泛应用于qPCR实时荧光定量PCR(用于基因表达分析和病原体检测)、二代测序NGS(用于全基因组测序、靶向测序和外显子组测序)、基因芯片(用于SNP分型和全基因组关联分析)、STR分型(用于法医个体识别和亲子鉴定)以及分子克隆(用于酶切连接等常规分子生物学操作)。
尿液样本应该如何采集和保存以保证cfDNA质量?
 尿液中的游离DNA(cfDNA)在采集后容易降解,因此建议:
  1. 立即处理:采集后应尽快进行核酸提取,最好在4小时内完成。
  2. 使用稳定剂:若无法及时处理,建议使用商业化的尿液稳定剂(如YALEPIC 尿液cfDNA保存等),可在常温下稳定cfDNA长达7-14天,有效防止DNase降解和细胞基因组DNA污染。
  3. 离心去细胞:提取前建议以1,600 × g离心10分钟去除细胞和碎片。
  4. 避免反复冻融:样本应避免反复冻融,以免导致DNA降解。
本试剂盒最低可以检测到多少cfDNA?回收率如何?
 本试剂盒采用高效的纳米磁珠富集技术,针对低丰度cfDNA进行了深度优化,模拟样本回收率可达≥80%,纯化产物无PCR抑制剂残留。健康人尿液cfDNA产量因个体差异较大,本试剂盒的磁珠富集技术可有效回收这些低丰度核酸片段。
提取的cfDNA纯度和片段大小是多少?
 本试剂盒提取的cfDNA产物A260/A280比值在1.7-2.0之间,纯度较高。尿液cfDNA通常以短片段形式存在,主要分布在50-300 bp之间(核心片段约150-200 bp),本试剂盒对低分子量核酸进行了定向优化,可高效回收这些短片段cfDNA。
该试剂盒是否适配自动化核酸提取仪?
可以。本试剂盒专为自动化提取场景优化,可适配市面主流的磁棒式自动化核酸提取仪,支持1-20ml大体积尿液样本的高通量自动化处理,尤其适合需要同时处理多个样本的实验室场景。
该试剂盒与同类产品(如 Q 牌、Z 牌等)相比有何优势?
 本试剂盒具有以下突出优势:
  • 大体积投入:最大支持20ml尿液样本,而许多竞品仅支持0.5-10ml;
  • 自动化兼容:优化的磁珠法流程完美适配自动化工作站,节省人工操作时间;
  • 高纯度:纳米磁珠+特制缓冲液系统有效去除尿液中的尿素、结晶体等抑制剂;
  • 成本效益:在保证高质量提取效果的同时,提供更具竞争力的价格;
  • 可提供备案版:支持医疗器械备案版本,满足临床转化需求。
试剂盒可以同时提取基因组DNA(gDNA)和游离DNA(cfDNA)吗?
 本试剂盒专为游离DNA(cfDNA)提取设计,直接从尿液上清中纯化cfDNA。如需从同一尿液样本中同时提取gDNA和cfDNA,建议将样本离心分离后分别处理:细胞沉淀用于gDNA提取,上清用于cfDNA提取,可选择搭配专门的尿液基因组DNA提取试剂盒使用。
试剂盒应该如何储存?有效期多长?
 本试剂盒在10-30℃室温条件下保存即可,有效期12个月。蛋白酶K组分建议在-20℃长期保存,溶解后可短期室温储存。所有组分避免阳光直射和潮湿环境。常温储存和运输的设计大幅降低了冷链成本,方便实验室日常使用。
试剂盒可以分多次使用吗?
 可以。试剂盒按48次规格提供,组分可多次取用。使用时请保持操作环境的洁净,避免交叉污染。开启后的试剂瓶应及时盖紧,按照说明书推荐的储存条件存放。磁珠悬浮液在每次取用前需充分混匀以确保磁珠分布均匀。
提取的cfDNA可以用于哪些下游实验?
本试剂盒提取的cfDNA产物纯度高、无抑制剂残留,可直接用于多种下游分子生物学实验,包括但不限于:qPCR、dPCR(数字PCR)、NGS文库构建、全基因组测序、靶向测序、甲基化检测、基因芯片分析等。
cfDNA提取产物中会有基因组DNA(gDNA)污染吗?
本试剂盒针对cfDNA进行了定向富集设计,有效减少基因组DNA的共纯化。但为了最大程度避免gDNA污染,建议在cfDNA提取前对尿液样本进行充分离心(1,600 × g离心10分钟),以去除细胞和细胞碎片。
提取的cfDNA产量很低,可能是什么原因?应如何解决?
产量偏低可能由以下原因引起:
可能原因 解决方法
样本中cfDNA本底含量低 增加起始样本量至最大允许量(20ml)
尿液样本未经稳定处理,cfDNA已降解 采集后立即处理,或使用尿液稳定剂
磁珠未充分混匀或结合时间不足 使用前充分涡旋磁珠,确保结合时间充分
洗脱体积过小 适当增加洗脱体积以提高总回收率
样本中含有高浓度抑制剂 确保按照说明书步骤充分洗涤
如何评估提取的cfDNA质量?
 建议通过以下方法评估提取的cfDNA质量:
  1. 紫外分光光度法:检测A260/A280比值,应在1.7-2.0之间;
  2. 琼脂糖凝胶电泳:尿液cfDNA通常以弥散条带形式出现在50-300 bp区域;
  3. qPCR检测:使用内参基因(如GAPDH、RNase P)进行扩增,通过Ct值评估产量和纯度;
  4. 片段分析仪:使用Agilent Bioanalyzer或类似设备精确分析cfDNA的片段大小分布。
  5. 对于极低丰度的cfDNA样本,传统的紫外分光光度法可能因灵敏度不足而无法准确检测,建议优先使用荧光定量法(如Qubit)或qPCR法进行定量评估。
该试剂盒是否有医疗器械备案?
 是的,本产品可提供医疗器械备案版本。备案版试剂盒在组分和生产工艺上与科研版保持一致,但额外满足医疗器械相关的质量体系要求,适用于IVD试剂盒研发、临床检测方法开发等需要合规资质的应用场景。如有医疗器械备案版需求,请联系雅礼生物销售团队。
尿液作为液体活检样本相比血液有哪些优势?
 尿液作为cfDNA来源具有以下显著优势:
  • 完全无创:样本采集无痛、无风险,患者接受度高;
  • 可重复采样:方便进行纵向研究和疾病动态监测;
  • 样本量大:尿液可获取大体积样本,弥补cfDNA丰度低的不足;
  • 背景干净:尿液蛋白浓度仅为血液的约1/1000,提取更容易,PCR抑制剂干扰较少;
  • 感染风险低:尿液对HIV等病原体的传染性远低于血液。
该试剂盒可以提取尿液中的病毒DNA吗?
可以。本试剂盒的磁珠富集技术对多种来源的游离DNA具有广泛的捕获能力,包括尿液中的病毒DNA(如HPV、EBV、巨细胞病毒等),适用于尿液病原体核酸检测等应用。
YALEPIC®
血液直扩裂解液可以用于哪些类型的血液样本?

本裂解液兼容广泛的血液样本类型,包括:新鲜采集的抗凝血(EDTA、肝素、柠檬酸钠抗凝均可)、4°C短期储存的血液、-20°C或-80°C长期冻存的血液,以及Whatman 903、FTA卡等商用血卡上的干血渍样本。不同类型的血液样本在裂解效果和下游扩增性能上均表现稳定。

YALEPIC®
血液直扩裂解液是否通过相关质量认证?是否可以用于临床诊断?

本产品严格按照医疗器械生产管理体系生产,每一批次均经过严格的质检放行。但根据中国医疗器械监管法规,本产品仅供科研使用,不可直接用于临床诊断。如需临床诊断用途,客户需自行完成相关注册和验证工作。雅礼生物可根据客户需求提供OEM定制和临床报证技术支持。

行业通用技术要点

以下内容为业界通用的技术原理与操作经验,用于补充理解,不构成对具体产品的指向。

尿液游离DNA浓度低如何保证提取质量?
尿液 cfDNA 常处于极低丰度且片段偏短,建议增大起始体积(如数十毫升)并配合富集与小体积洗脱;添加 EDTA 等专用防腐剂可在室温稳定数天。
唾液样本采集有哪些注意点?
避免进食、饮水或刷牙后短期内采集以减少污染;唾液含黏液与酶,宜配合黏液溶解与核酸酶抑制步骤,并尽快处理或稳定保存。

相关产品

YALEPIC® 磁珠法尿液游离DNA大量提取试剂盒
联系电话 0512-66256010
👤登录 🛒商城
💬咨询
×
微信扫码咨询
扫描下方二维码,添加我为好友
微信咨询二维码 关闭