体液样本DNA提取FAQ
尿液、唾液等体液的游离核酸浓度低、易降解。本专题涵盖采集量、保存条件与纯度对高通量测序的要求。
雅礼官方解答(34 条)
YALEPIC®
适用于RT-PCR、RT-qPCR基因表达分析、全长cDNA克隆、RNA-seq文库构建、杂交等多种下游应用。特别适合具有复杂二级结构的RNA模板及低丰度基因的逆转录。
唾液样本采集时有哪些注意事项?
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采集前30分钟内避免进食、饮水、吸烟或咀嚼口香糖,以免影响DNA质量;
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采集前可用清水轻轻漱口,去除口腔中的食物残渣;
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建议采集200~500 μL新鲜唾液作为起始样本量(可根据实验需求适当调整);
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采集后如无法立即提取,可将唾液与唾液保存液按推荐比例混合(通常为1:1),室温保存可达数周至数月而不影响DNA质量;
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避免唾液中混入过多气泡,气泡可能导致样本体积计量不准。
本试剂盒可提取的最小唾液样本量是多少?
提取的DNA纯度和浓度是否满足二代测序要求?
试剂盒是否可用于提取口腔拭子样本中的DNA?
试剂盒为什么不含RNase A?如果我想获取总RNA怎么办?
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部分下游应用(如同时分析DNA和RNA、RNA干扰研究等)需要在提取过程中保留RNA组分;
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不含RNase A的试剂盒可为用户提供更大的实验灵活性,用户可根据实际需求选择是否添加RNase A。
如需获取总RNA: 用户可在裂解步骤后向样本中加入适量RNase A溶液(试剂盒未提供,需自备或另购),37℃孵育15~20分钟后继续后续操作。如需在提取DNA的同时保留RNA用于后续检测,建议使用专门为DNA/RNA共提取设计的试剂盒。
试剂盒的常温保存稳定性如何?开封后可以保存多久?
提取的DNA中是否含有PCR抑制剂?如何判断?
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内参扩增对照法: 将已知浓度的标准DNA模板与等量提取的DNA混合后进行PCR扩增,比较扩增效率;
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A260/A230比值法: A260/A230比值<1.8提示可能存在胍盐、多糖或其他抑制物残留;
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浓度梯度稀释法: 将提取的DNA进行梯度稀释后进行PCR,观察扩增曲线是否呈线性关系。
产品是否支持自动化提取或高通量操作?
提取的DNA能否长期保存?保存条件是什么?
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-20℃保存: 溶解于洗脱液或无核酸酶水中,可保存6~12个月,适合中短期存储;
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-80℃保存: 可长期保存(数年以上),建议分装为小管以避免反复冻融导致的DNA降解;
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4℃短期保存: 提取后3~5天内使用的DNA可暂存于4℃。
如何提高低丰度唾液样本的DNA得率?
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增加样本起始量: 在不超出离心柱载量(通常≤30 μg DNA)的前提下,适当增加唾液样本体积至600~800 μL;
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优化裂解时间: 将裂解步骤延长至15~20分钟,必要时提高裂解温度至65℃;
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减少洗脱体积: 采用50 μL(而非100 μL)洗脱液洗脱,提高DNA浓度;
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两次洗脱合并: 用30~40 μL洗脱液洗脱两次,合并收集管中的DNA溶液;
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洗脱液预热: 将洗脱液预热至65~70℃后再加入吸附柱,可提升洗脱效率;
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延长洗脱孵育时间: 加入洗脱液后室温放置2~5分钟再离心,确保DNA充分溶解。
试剂盒是否适用于含保存液的唾液样本?
YALEPIC®
本试剂盒适用于新鲜唾液样本、含保存液的唾液样本以及口腔拭子样本。样本收集过程无痛、无创,受试者仅需吐取适量唾液即可完成采样,既适用于医院检验科和第三方医学检验所的批量检测,也适用于科研院校的遗传学研究及法医鉴定机构的人员筛查。
本试剂盒的提取产量和纯度如何?能否用于下游NGS实验?
手工操作需要多长时间?自动化提取需要多长时间?
本试剂盒与传统柱式法相比有什么优势?
提取的DNA可以用于哪些下游应用?
尿液样本应该如何采集和保存以保证cfDNA质量?
- 立即处理:采集后应尽快进行核酸提取,最好在4小时内完成。
- 使用稳定剂:若无法及时处理,建议使用商业化的尿液稳定剂(如YALEPIC 尿液cfDNA保存等),可在常温下稳定cfDNA长达7-14天,有效防止DNase降解和细胞基因组DNA污染。
- 离心去细胞:提取前建议以1,600 × g离心10分钟去除细胞和碎片。
- 避免反复冻融:样本应避免反复冻融,以免导致DNA降解。
本试剂盒最低可以检测到多少cfDNA?回收率如何?
提取的cfDNA纯度和片段大小是多少?
该试剂盒是否适配自动化核酸提取仪?
该试剂盒与同类产品(如 Q 牌、Z 牌等)相比有何优势?
- 大体积投入:最大支持20ml尿液样本,而许多竞品仅支持0.5-10ml;
- 自动化兼容:优化的磁珠法流程完美适配自动化工作站,节省人工操作时间;
- 高纯度:纳米磁珠+特制缓冲液系统有效去除尿液中的尿素、结晶体等抑制剂;
- 成本效益:在保证高质量提取效果的同时,提供更具竞争力的价格;
- 可提供备案版:支持医疗器械备案版本,满足临床转化需求。
试剂盒可以同时提取基因组DNA(gDNA)和游离DNA(cfDNA)吗?
试剂盒应该如何储存?有效期多长?
试剂盒可以分多次使用吗?
提取的cfDNA可以用于哪些下游实验?
cfDNA提取产物中会有基因组DNA(gDNA)污染吗?
提取的cfDNA产量很低,可能是什么原因?应如何解决?
| 可能原因 | 解决方法 |
|---|---|
| 样本中cfDNA本底含量低 | 增加起始样本量至最大允许量(20ml) |
| 尿液样本未经稳定处理,cfDNA已降解 | 采集后立即处理,或使用尿液稳定剂 |
| 磁珠未充分混匀或结合时间不足 | 使用前充分涡旋磁珠,确保结合时间充分 |
| 洗脱体积过小 | 适当增加洗脱体积以提高总回收率 |
| 样本中含有高浓度抑制剂 | 确保按照说明书步骤充分洗涤 |
如何评估提取的cfDNA质量?
- 紫外分光光度法:检测A260/A280比值,应在1.7-2.0之间;
- 琼脂糖凝胶电泳:尿液cfDNA通常以弥散条带形式出现在50-300 bp区域;
- qPCR检测:使用内参基因(如GAPDH、RNase P)进行扩增,通过Ct值评估产量和纯度;
- 片段分析仪:使用Agilent Bioanalyzer或类似设备精确分析cfDNA的片段大小分布。
- 对于极低丰度的cfDNA样本,传统的紫外分光光度法可能因灵敏度不足而无法准确检测,建议优先使用荧光定量法(如Qubit)或qPCR法进行定量评估。
该试剂盒是否有医疗器械备案?
尿液作为液体活检样本相比血液有哪些优势?
- 完全无创:样本采集无痛、无风险,患者接受度高;
- 可重复采样:方便进行纵向研究和疾病动态监测;
- 样本量大:尿液可获取大体积样本,弥补cfDNA丰度低的不足;
- 背景干净:尿液蛋白浓度仅为血液的约1/1000,提取更容易,PCR抑制剂干扰较少;
- 感染风险低:尿液对HIV等病原体的传染性远低于血液。
该试剂盒可以提取尿液中的病毒DNA吗?
YALEPIC®
本裂解液兼容广泛的血液样本类型,包括:新鲜采集的抗凝血(EDTA、肝素、柠檬酸钠抗凝均可)、4°C短期储存的血液、-20°C或-80°C长期冻存的血液,以及Whatman 903、FTA卡等商用血卡上的干血渍样本。不同类型的血液样本在裂解效果和下游扩增性能上均表现稳定。
YALEPIC®
本产品严格按照医疗器械生产管理体系生产,每一批次均经过严格的质检放行。但根据中国医疗器械监管法规,本产品仅供科研使用,不可直接用于临床诊断。如需临床诊断用途,客户需自行完成相关注册和验证工作。雅礼生物可根据客户需求提供OEM定制和临床报证技术支持。
行业通用技术要点
以下内容为业界通用的技术原理与操作经验,用于补充理解,不构成对具体产品的指向。